Adli Bilimler Enstitüsü, Ankara Üniversitesi Adli Tıp Enstitüsü olarak, 2659 sayılı Adli Tıp Kurumu Kanununun öngördüğü alanlarda lisansüstü eğitim öğretim ve araştırma yapmak, ekspertiz yapabilecek uzman ile bu alanlarda öğretim elemanı yetiştirmek üzere 28 Mart 1983 tarihinde 2809 sayılı Kanunla kurulmuştur. 1983 – 1985 yılları arasında Enstitü Müdürlüğü görevini Prof. Dr. Adnan ÖZTÜREL; 1985 – 1989 yılları arasında Yrd. Doç. Dr. Özer KENDİ; 1989 – 1991 yılları arasında, Prof. Dr. İbrahim TUNALI; 1991-2003 yılları arasında Prof. Dr. Bahattin KORUCU; 2003 – 2010 yılları arasında Prof. Dr. Halil GÜMÜŞ, 2010 – 2013 yılları arasında Prof. Dr. Tülin SÖYLEMEZOĞLU; 2013 – 2015 yılları arasında  Prof. Dr. İsmail Hamit HANCI; 22 Ocak 2015 – 14 Şubat 2016 tarihleri arasında Prof. Dr. Aslıhan GÜRBÜZ; 15 Şubat 2016 – 3 Kasım 2022 tarihleri arasında Prof. Dr. H. Sinan SÜZEN  Adli Bilimler Enstitüsü Müdürlüğü görevini sürdürmüştür. Prof. Dr. Nebile DAĞLIOĞLU 21 Haziran 2023 tarihinden itibaren Enstitü Müdürlüğüne atanmıştır.

Adli Tıp Enstitüsünün adı,  25.10.2010 tarih ve 2010/1046 sayılı Bakanlar Kurulu kararı ile Adli Bilimler Enstitüsü olarak değiştirilmiştir. Enstitü, Adli Toksikoloji, Kriminalistik, Adli Biyoloji, Adli Genetik ve Adli Psikoloji olmak üzere beş anabilim dalına sahiptir. Yükseköğretim Yürütme Kurulunun 18.05.1993 tarih ve 93.19.794 sayılı kararı gereği, 2024-2025 eğitim ögretim yılına kadar tüm lisansüstü eğitim-öğretim faaliyetleri, Ankara Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsüne bağlı Disiplinlerarası Adli Bilimler Anabilim Dalı altında sürdürülmüştür. 2024 – 2025 eğitim-öğretim yılı itibariyle tüm lisansüstü programlar, Adli Bilimler Enstitüsü bünyesine aktarılmıştır. Diğer faaliyetlerini Rektörlüğe bağlı olarak sürdürmektedir.